電子政務北京網站建設開發的直接目的就是為了網站可靠運營并承擔相應政務功能。電子政務北京網站建設的有效運行固然需要廣大老百姓的關注和參與，但政府服務的流程和效率及在此基礎上對政務網站科學合理的設計與開發、快速及時的網站更新和信息內容的發布與反饋等網站管理維護工作才是電子政務網站真正能夠發揮作用的關鍵。從本質上來講，電子政務網站建設的管理和維護是指對網站輸入與輸出兩個方向的信息流動(也就是從政府流出的和從政府外部流入的信息流)的管理和監控，以保證政府網上業務處理安全而順利地進行，并確保整個網站內容的完整性和一致性，從而提高政府的工作質量，并為社會公眾提供快捷服務。從內容上看，電子政務網站運營中的管理和維護就是要結合政府機關的具體工作職能，保證數據和信息內容的完整性、一致性、權威性和及時性。因此，這方面的工作主要包括電子政務網站文件內容、目錄結構和文件傳愉的管理、信息審核與發布的管理和維護、網站企業用戶和個人用戶的數據資料管理、法律法規的更新廢除和發布通告管理。當然，為了解網站建設的績效、存在的缺陷和改進的方向，采用定性成定量的方法，結合專家訪問和用戶調查進行網站運營管理的評價或評估是很有必要的。通過網站評估和用戶反饋，應及時改進網站的不足之處，進行網站改版和升級。
最后，電子政務網站作為政府在互聯網上的形象代表和辦公手段，其安全問題不容忽視。電子政務網站的安全管理是建立在包括人員安全教育、技術安全實施和設施設備安全運轉等在內的多層次、多內容安全管理體系，需要在電子政務建設規劃中予以明確，其實現既依賴于國家或社會宏觀層面的安全技術保障、安全支持服務及墓礎設施建設，也要求網站所有者結合其安全需求構建科學合理的安全管理策略。